Salut,
Le java, dans son approche, n'a pas grand chose à voir avec PHP :
PHP est du code interprêté par un serveur d'application très léger (bien souvent apache). Du coup, tu mets un fichier php côté serveur, et ca marche tout seul
Java est bien plus professionnel. Il te faut un serveur d'application qui, au strict minimum peut compiler les jsp, et exécuter les classes java. Le plus utilisé étant apache tomcat.
Ensuite, ca se complique : java, c'est pas uniquement faire un simple fichier, c'est faire des classes respectant un certain standard, paramètrer les fichiers de configuration (nottament le web.xml), élaborer des pages jsp qui seront compilées afin que le serveur d'application génère du code HTML envoyé au navigateur. Bref, c'est un tout autre processus de développement !
Je te conseille de lire les excellents tutoriaux de developpez.com sur J2EE pour te faire un idée et pouvoir commencer la programmation J2EE.
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DarK Sidious